В 1897 году из-за резкого ухудшения здоровья врачи запретили Антону Павловичу жить под Москвой. Чехов стал приезжать в Мелихово только летом, зиму проводил сначала на юге Франции, а потом в Крыму. Осенью 1898 года умер отец писателя, и в начале августа 1899 года Мелихово было продано.

С 1899 по 1904 год А. П. Чехов жил в Ялте, но здоровье его продолжало ухудшаться. В мае 1904 года тяжело больной Антон Павлович поехал для лечения на немецкий курорт Баденвейлер. Однако здоровье его было уже подточено. В ночь на 2(15) июля 1904 года Чехов умер. 9 июля Москва хоронила своего любимого писателя. Свинцовый гроб всю дорогу от Николаевского (ныне Ленинградский) вокзала до Новодевичьего кладбища несли на руках. «Несметные толпы народа сопровождали гроб»,— вспоминал брат писателя М. П. Чехов.

Шли годы. Имение Мелихово, владельцем которого стал барон Стюарт, приходило в упадок. А интерес к Чехову рос с каждым годом, и в Мелихово стали приезжать и приходить экскурсанты. В 1914 году, в десятую годовщину со дня смерти писателя, в журналах появились воспоминания о Чехове, фотографии Мелихова из архива Антона Павловича.

В 1924 году жители Мелихова в связи с 20-летием со дня смерти Чехова провели торжественное собрание. Многие из них еще помнили писателя и всячески оберегали все, что было связано с его памятью. Они продолжали поддерживать связь с Марией Павловной, сестрой Антона Павловича, работавшей в эти годы директором Дома-музея А. П. Чехова в Ялте.

В марте 1940 года состоялось решение исполкома Мособлсовета об организации в Мелихове Музея А. П. Чехова. При помощи я;ивших в этих местах современников Чехова были собраны книги с его автографами, фотографии, письма. На усадьбе к этому времени оставался в целости лишь флигель. Он был отремонтирован, и в нем проводилась работа по воссозданию обстановки жизни писателя в мелиховские годы.

Менее чем через год, в январе 1941 года, во флигеле открылся Музей А. П. Чехова. Однако проработал он всего несколько месяцев. Началась Великая Отечественная война. Линия фронта подошла близко к Мелихову, но и в эти тревожные и трудные дни мелиховские старожилы бережно охраняли чеховский флигель.